次日10月初5日，幕府從四位下侍從兼豐後國小倉城主：細川忠興，再次率領倭軍兵臨尚慶右道晉州牧城下。

當得知城中隻有三千多名李氏朝鮮守軍的時候，讓幕府從四位下侍從非常高興，他認為又將是一次輕而易舉的勝利？

可就在倭軍們架起梯子攻城時，李氏朝鮮軍隊卻使用大炮、弓箭、火繩槍，對準攻城的倭軍發起猛烈射擊，使得倭軍傷亡慘重，也讓幕府從四位下侍從甚為震驚，他連忙下令鐵炮隊使用火繩槍的火力，用來掩護本部軍隊攻城。

但守城的李氏朝鮮軍卻冒著彈雨，使用石塊和斧頭摧毀了攻城梯，待攻城梯被摧毀後，李氏朝鮮軍又在城樓上，使用火繩槍居高臨下地對倭軍發起射擊，導致倭軍的傷亡更加慘重。

雙方在持續戰鬥了第三天後，李氏朝鮮晉州牧使：金時敏，被鉛彈擊中頭部，傷重無法繼續指揮戰鬥！

這被幕府從四位下侍從探知後，便又發起了更為猛烈的攻城，還試圖借此機會摧毀李氏朝鮮守軍們的鬥誌，雖然李氏朝鮮守軍們堅持奮戰，但卻沒有統一的領導，處於非常不利的地位。

此時李氏朝鮮義軍統領：郭再佑，得知倭軍攻打晉州牧之事，他立即率領二千餘人的義軍馳赴晉州牧，並發起遊擊戰，趁夜偷襲了倭軍營地。

郭再佑身穿紅色緋緞所織成的戰袍，率義軍迅速闖入倭軍營地內，突襲毫無防備的倭軍士兵，並故意發出巨大聲響以製造恐慌，隨後便消失地無影無蹤。

因此倭軍對郭再佑都十分畏懼，稱他為「天降紅衣將軍」。

經過這次襲擊之後幕府從四位下侍從，也意識到如此下去幕府軍隊必然損失慘重，隻得下令撤退，才讓李氏朝鮮軍隊成功守住了晉州牧。

此次的晉州牧大捷與閒山島大捷、幸州城大捷，並稱為；李氏朝鮮王國在壬辰衛國戰爭中的三大捷，而晉州牧大捷的勝利，也相繼傳到李氏朝鮮八道各地，很大程度上鼓舞了李氏朝鮮軍隊原本低落的士氣。

10月25日，在大明帝國的東北方建州左衛軍民指揮所裡面誕生了一位對手，那就是明建州左衛軍民指揮使：愛新覺羅·努爾哈赤，側福晉：納拉·孟古哲哲，所生的兒子，明建州左衛軍民指揮使的第八子：愛新覺羅·紅歹是（女真文：黃台吉）。

同時李氏朝鮮全羅左道水軍節度使兼三道水軍統製使：李舜臣，仍兼本職，負責指揮全羅左右道、忠清左右道、尚慶左右道，這三道的水師軍隊。

其麾下擁有；110艘戰船、110艘斥候船、士兵餘人，專門負責打擊沿海地區倭軍，但恰逢大明與幕府和談期間，因此李氏朝鮮全羅左道水軍節度使兼三道水軍統製使就顯得有些多餘了，無用武之地！

而此時，一意主和的明遼東經略：宋應昌，卻發覺倭方尚未準備好幕府關白：豐臣秀吉，的投降書？

於是明遼東經略就命明禦倭遊擊將軍：沈惟敬，第四次複入倭營促謝表，明禦倭遊擊將軍於同年12月初7日，再入幕府第一軍左副將：小西行長，的軍營中展開和談。

明萬曆二十二年公元1594年正月初3日，幕府第一軍左副將：小西行長、幕府：小西飛，與明禦倭遊擊將軍：沈惟敬，等人終於偽造了一封幕府關白：豐臣秀吉，的《關白降表》。

不過當時關於幕府關白提出的議和條件書，卻沒有報告給大明朝廷，僅僅隻是圍繞在大明內部群臣們商議要不要與幕府議和之事？而展開了激烈的爭論。

正月20日，明神宗：朱翊鈞，下詔說道“去年各大布政司災傷，以；山東承宣布政使司、河南承宣布政使司，以及南直隸徐州、淮安府，等處尤為嚴重！朕屢次下令救濟，不知有司是曾否奉行？百姓是否得到實惠？值此公私交困之時，不知各地除了動用國庫錢糧之外，是否有急救便宜措施？各地鬨事的礦徒是否已經安置歸農？今日四方吏治，全不講求荒政，牧養小民，惟以搏擊風力為名聲，交際趨承為職業，費用侈於公庭，追呼偏於閭裡，囂論者不能禁止，流亡者不能招徠，遇有盜賊，則互相隱匿，或故意徇私，以求免地方失事之咎，而各地巡撫、巡按官亦止知請振請蠲，不能汰一苛吏，革一弊法，如此上下相蒙，釀成盜賊之患，朕甚憂之，自今當以安民弭盜為有司之黜陟，如有仍前欺隱及玩視詔令者，當重治不宥。”

2月12日，明吏部文選清吏司郎中：顧憲成，先因反對三皇子並封王之事而觸犯了明神宗，後又在一年一度的「京察」中因支持明吏部尚書：孫瓏，而得罪了明內閣首輔：王錫爵。

恰逢王閣老致仕（辭官）群臣們開始會推閣臣，先前由明吏部文選清吏司郎中：顧憲成，推舉明東閣大學士：王家屏，明神宗棄而不用。

他又舉薦了明吏部尚書：孫瓏、明刑部尚書：孫丕揚，被明神宗發怒而革去其職。

待顧憲成回到故裡南直隸常州府無錫縣，與弟弟顧允成共同倡議重修東林書院，之後並與明揭陽縣典史：高攀龍、明都察院福建道監察禦史兼廣西巡按：錢一本、明光州學正：薛敷教、明太仆寺少卿：史孟麟、明安吉州判官：於孔兼，諸人一起講學其中，每歲一大會，每月一小會。

時士大夫懷誌而為當局罷斥者，多聞風響附，學舍至不能容，講學之餘，往往諷議時政裁量人物，朝內的官員亦遙相應和，由是東林之名大著。

人稱顧憲成等辭官大臣為「東林黨」其後，明刑部尚書：孫丕揚、明南直隸吏部員外郎：鄒元標、明吏部考功清吏司郎中：**星，等人也相繼到此講學，自負氣節，願與朝廷相抗，是為東林黨之議開始。

而浙江承宣布政使司寧波府鄞縣人士，明詹事府少詹事兼翰林院侍讀學士：沈一貫，以善於奉承因此得明神宗歡心，遂入內閣，成為浙江承宣布政使司派係官僚首領，人稱為〈浙黨〉。

東林黨人以講學聯絡人士，浙黨人恃權求勝，從此東林黨、浙黨，之間互相爭鬥長達五十年。

5月28日南直隸鳳陽行都督府潁州百姓：王自簡，聚眾千人發動造反，旋即遭到官軍鎮壓。

6月20日，朝廷以明潁州兵備道副使：李驥，等俘獲王自簡等人有功，下令嘉獎，並各賞銀有差。

10月23日，與明薊遼總督：顧養謙，一起力主對幕府議和封貢的明兵部尚書：石星，再次上疏請儘快封貢幕府，並說道“當初幕府倭軍攻占李氏朝鮮王國，是利用其威，及其退還王京、送回王子和陪臣，是講食用，陛下慨然許封，則當儘快封之，一封而倭寇以退，李氏朝鮮王國以保，外患以息，內備以修，今倭軍久住釜山浦，我朝之欲封不封，既已失信！彼之請封未封，必複生疑，故封後而勒令儘歸，宜無不得，封前而數為責備，似難必行，宜一面令倭使：小西飛，進京確示予封之信，一面令侵朝倭軍統帥：小西行長，即退以待冊使往之，即使小西行長不敢速歸，待冊使至而返，亦無不可，封則李氏朝鮮王國暫安，得自為戰守，若複設難成之約，則禍及李氏朝鮮王國，全羅左右道必失，我遼東都指揮使司亦難以支持，若封後有反複，臣願自往蒞，事不濟則治臣罪。”

於是明神宗聽後覺得有理，就讓司禮監太監們去傳詔幕府使者：小西飛，火速進京確認禦旨，

雙方在內城太仆寺內談判，大明官員提出說“我皇陛下讓我們來傳話，令幕府倭軍儘早退出李氏朝鮮，若你們執意不退的話？那麼我朝則興兵正罪勢必要剿滅你們。”

但幕府使者就提出道“大和語：我軍在受封之後，可以迅速撤離李氏朝鮮王國，但是咱們隻冊封而不準朝廷求進貢，其次朝廷必須與李氏朝鮮王國修好不得侵犯我國。”

由於明使不太懂大和語！因此幕府使者就和明禦倭遊擊將軍：沈惟敬，一起欺瞞明使，為了穩住他們就謊稱皆以穩妥，並傳遞幕府的降書給明兵部尚書觀看。

不明真相的明兵部尚書大喜，在場的大明官員們也很是高興，連忙上奏明神宗，又帶著倭使進宮向大明天子獻禮。

12月30日，明神宗從明兵部尚書之請，命明臨淮候勳衛署都督僉事：李宗城，為正使、明五軍營右副將署都督僉事：楊方亨，為副使，各賜武官一品服，並帶著［郡王常服］與冠冕前往李氏朝鮮王國釜山浦封幕府關白：豐臣秀吉，為幕府國王兼大明郡王。

明萬曆二十三年公元1595正月初3日，明鄭恭親王：朱厚烷，長子明鄭恭親王世子：朱載堉，奏請“宗室子弟，皆得儒服就試，中式者無論中外職，視才器使。”

明神宗從其奏請，後經禮部大臣會議，至明萬曆三十三年公元1605年12月初1日才正式施行，但規定宗室子弟和及第之後不得授予京朝官。

5月11日，明四川總督：邢玠，下令讓明重慶府知府：王士琦，單騎趕赴播州宣慰使司，在鬆坎裡收到戰報接見了明播州宣慰使：楊應龍，他帶手下五花大綁前來。

這一次明播州宣慰使不施展兵法，玩起了演技，把自己捆綁起來，跪在路旁痛哭請罪，還雙膝下跪去迎接明重慶府知府，期間一直磕頭磕到頭破血流。

他還主動獻出了明播州宣慰使司副使：黃元、明播州宣慰使司僉事：阿羔、明播州宣慰使司經曆使：阿苗，等十二個替死鬼，以抵銷自己的罪責，並認罰四萬金，並協助朝廷采木。